Algorítmos para manipulação de cadeias, sequências e árvores com aplicações em Biologia Molecular. Aplicações da Teoria dos Grafos e Otimização. Ferramentas para bioinformática
Bibliografia Setúbal, J., Meidanis, J. INTRODUCTION TO COMPUTATIONAL MOLECULAR BIOLOGY, PWS Publishing Co., 1977 Gusfield, D., ALGORITHMS ON STRINGS, TREES AND SEQUENCES: COMPUTER SCIENCE AND COMPUTATIONAL BIOLOGY
EMENTA: Algorítmos para manipulação de cadeias, sequências e árvores com aplicações em Biologia Molecular. Aplicações da Teoria dos Grafos e Otimização. Ferramentas para bioinformática
Introdução à computação. Ambientes de programação. Redes de Computadores. Banco de dados. Ambientes unix. Ambientes de alto desempenho.
Bibliografia Variável inculindo textos e artigos abordando o tema computação e programação.
Estudos do genoma: a estrutura dos genomas eucariotos e procariotos, a organização do genoma e da cromatina em eucariotos, os polimorfismos de DNA e métodos para sua detecção, o sequenciamento e anotação de genomas, genômica comparativa, metagenômica, filogenia, a edição de genomas, e disrupção de genes, a epigenômica. Estudos do transcriptoma: o controle transcricional e pós transcricional da expressão gênica, o estudo do transcriptoma por RNA-Seq e de célula única (scRNA-Seq), as metodologias de detecção de transcritos, o estudo da expressão diferencial de transcritos, o estudo dos transcritos no nível de isoformas, os RNAs não codificadores, RNA de interferência, knockdown de transcritos, a edição de transcritos, a epitranscriptômica. Estudos do proteoma: o controle traducional e pós-traducional da expressão gênica, obtenção de mapas peptídicos, metodologias de sequenciamento de proteínas, comparação do proteoma de células e a expressão diferencial de proteínas, redes de interação proteína-proteína, a biologia de sistemas.
Ementa: Estudos do genoma: a estrutura dos genomas eucariotos e procariotos, a organização do genoma e da cromatina em eucariotos, os polimorfismos de DNA e métodos para sua detecção, o sequenciamento e anotação de genomas, genômica comparativa, metagenômica, filogenia, a edição de genomas, e disrupção de genes, a epigenômica. Estudos do transcriptoma: o controle transcricional e pós transcricional da expressão gênica, o estudo do transcriptoma por RNA-Seq e de célula única (scRNA-Seq), as metodologias de detecção de transcritos, o estudo da expressão diferencial de transcritos, o estudo dos transcritos no nível de isoformas, os RNAs não codificadores, RNA de interferência, knockdown de transcritos, a edição de transcritos, a epitranscriptômica. Estudos do proteoma: o controle traducional e pós-traducional da expressão gênica, obtenção de mapas peptídicos, metodologias de sequenciamento de proteínas, comparação do proteoma de células e a expressão diferencial de proteínas, redes de interação proteína-proteína, a biologia de sistemas Pré-requisito: Ter cursado Biologia Molecular na Pós-graduação ou na GraduaçãoO papel da Estatística na área biológica. Análise descritiva e exploratória de dados. Introdução à probabilidade e qualidade de testes diagnósticos. Algumas distribuições de probabilidade.
Introdução a Processos Estocásticos. Introdução à inferência estatística. Comparação de dois grupos: inferência sobre duas médias. Análise de dados categorizados Análise de variância. Análise de correlação e regressão.
Ementa: Probabilidade: Definição de variáveis aleatórias. Esperança e variância. Vetores aleatórios. Distribuição condicional. Independência. Processos estocásticos: Cadeias de Markov e Processos de Poisson. Inferência: Estimação pontual e intervalar. Teste de hipóteses. Tópicos especiais.
Apresentação de seminários ministrados por alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, sobre pesquisas na área da Bioinformática.
Apresentação de seminários ministrados por alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, sobre pesquisas na área da Bioinformática.
Apresentação de seminários de alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, na área de Bioinformática.
Apresentação de seminários ministrados por alunos de Mestrado e Doutorado do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática, de docentes da UFMG e convidados nacionais e internacionais, sobre pesquisas na área da Bioinformática.
Conteúdo variável para cada turma
Ementa: Métodos e estratégias consideradas estado-da-arte em tópicos como triagens virtuais, docking e dinâmica molecular, QSAR e machine learning com o foco em planejamento de substâncias bioativas.
Conteúdo variável para cada turma
Ementa: Introdução a genômica, Organização genômica de bactérias benéficas, ferramentas e Banco de dados especializados, Reconstrução de vias metabólicas, Anotação de biomoléculas probióticas, Análises evolutivas e ecológicas de microrganismos comensais. Pré-requisito: Conhecimento em Biologia molecular
Conteúdo variável para cada turma
Ementa: Embasamento teórico-prático para compreender os fundamentos do Design Thinking, destacando sua aplicação no contexto da bioinformática. Desenvolvimento de estudo de caso, mapeamento de stakeholders, metodologias de ideação, com ênfase na geração criativa de soluções e no uso de ferramentas colaborativas. Essa disciplina busca capacitar os alunos a transformar sua pesquisa científica em um produto no mercado.Conteúdo variável para cada turma
Ementa: Objetivo Geral: Capacitar os estudantes a conduzirem revisões sistemáticas e meta-análise, utilizando como suporte a Inteligência Artificial, proporcionando uma compreensão abrangente e prática dos métodos e técnicas envolvidos nesse processo. Pré-requisito: Internet, acesso à rede da universidade, link de acesso (zoom ou google meet); BIBLIOGRAFIA: 1.Cochrane Handbook for Systematic Reviews of Interventions 2. PRISMA Statement (Preferred Reporting Items for Systematic Reviews and Meta-Analyses) 3.Livros e artigos relevantes sobre o tema, conforme a evolução da área.
Seminários online com palestrantes internacionais I - Braz Webinars
Seminários online com palestrantes internacionais na área de bioinformática, genômica, genética, evolução, microbiologia, e afins. A programação completa está anunciada no site http://bioinfo.icb.ufmg.br/BrazWebinars e os participantes da disciplina podem participar antes do início da disciplina e depois.
Conteúdo variável para cada turma.
Ementa: Avaliação da segurança no estudo de produtos potencialmente terapêuticos segundo legislações vigentes dos principais órgãos reguladores mundiais e tendências em métodos alternativos. Pré-requisito: Não se aplica
Conteúdo variável para cada turma.
Ementa: Concept of Precision Health; Gene-environment interactions in Health Outcomes; Biomarkers and their Applications in Precision Health; Genomics and Personal genome ; Genetic Tests, Types, and Methods; Implementations of Genetic tests in Precision Health; Bioinformatics for Genetic Tests; Entrepreneurship opportunities in Genetic Test Sector; Hands-on (Project): Problem oriented research project design and execution (Hands-on): Identify and select Research Problem and Design the Research Project; Clinical Exome analysis and Interpretation (Hands-on) OR; Transcriptome analysis and Interpretation (Hands-on); Writing Research Paper.
Bibliografia: Barh et al., 2013: Omics for Personalized Medicine; ISBN 9788132211846, Springer 2.Kulkarni & Roy, 2014: Clinical Genomics; ISBN: 9780124047488, Elsevier 3.Barh & Verma., 2016: Progress and Challenges in Precision Medicine; ISBN: 9780128094112, Elsevier 4.Dhar et al., 2020: Handbook of Clinical Adult Genetics and Genomics; ISBN: 9780128173442, Elsevier 5.Barh D., 2020: Precision Medicine in Cancers and Non-Communicable Diseases; ISBN: 9780367571030, Taylor & Francis 6.Aydogan et al., 2020: Precision Medicine in Oncology; ISBN:9781119432487, John Wiley & Sons 7.Barh & Ahmetov, 2019: Sports, Exercise, and Nutritional Genomics; ISBN: 9780128161937, Elsevier 8.Carini et al, 2019: Handbook of Biomarkers and Precision Medicine; ISBN: 9780367730055, Taylor & Francis 9. Barh D., 2020: Artificial Intelligence in Precision Health; ISBN: 9780128173381, Elsevier
Participação do estudante no ensino prático e teórico da Bioinformática, visando a aquisição de experiência para o exercício de suas atividades didáticas, sob orientação de professor tutor designado em comum acordo com o docente coordenador da disciplina
Participação do estudante no ensino prático e teórico da Bioinformática, visando a aquisição de experiência para o exercício de suas atividades didáticas, sob orientação de professor tutor designado em comum acordo com o docente coordenador da disciplina